循环RNA分析器
circRNAprofiler：一种基于R的环状RNA下游分析计算框架
生物导体版本：释放（3.19）
基于R的计算框架，用于对circRNAs进行全面的电子分析。该计算框架允许合并和分析之前由多个公开可用的基于注释的circRNA检测工具检测到的circRNAs。它涵盖了circRNAs分析的不同方面，从差异表达分析、进化保护、生物发生到功能分析。
作者：西蒙娜·奥菲罗
维护人员：Simona Aufiero<gmail.com上的simo.Aufiero>
引文（从R中输入引文（“circRNAprofiler”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“circRNAprofiler”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“circRNAprofiler”）
细节
| 生物视图 |
注释,差异表达式,功能预测,基因预测,基因组组装,软件,结构预测 |
| 版本 |
1.18.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.10（R-3.6）（5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
数字播放器,马格里特,阅读器,rtracklayer公司,字符串,条纹,DESeq2公司,边缘R,基因组范围,I范围,顺序,R.utils公司,重新整形2,ggplot2，实用程序，爱尔兰航空公司,S4载体，统计，基因组信息Db,普世运动,批注中心,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,生物串,格瓦斯卡特,牛基因组 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/Aufero/circRNAprofiler（https://github.com/Aufero） |
| Bug报告 |
https://github.com/Aufero/circRNAprofiler/issues |
查看更多
| 建议 |
测试那个,针织物,氧气2,rmarkdown公司,开发工具,额外网格,ggpubr公司,维恩图,英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC毫米9,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC毫米10,生物技术经理 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
