cfdnakit公司

无细胞DNA（cfDNA）高通量测序的片段长度分析包

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包提供了分析无细胞DNA（cfDNA）浅全基因组测序（约0.3倍或更多）的基本功能。该软件包基本上提取cfDNA片段的长度，并有助于片段长度信息的可视化。该软件包还提取每个不重叠的固定大小箱子的片段长度信息，并用于计算ctDNA估计得分（CES）。

作者：Pitithat Puranachot【aut，cre】

维护人员：Pitithat Puranachot<pittat at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“cfdnakit”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“cfdnakit”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“cfdnakit”）

生物视图	副本编号变化,排序,软件,全基因组
版本	1.2.0
在生物导体中	生物柴油3.18（R-4.3）（1年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=4.3）
进口	博科生物,数字播放器,基因组范围,基因组信息Db,ggplot2,I范围,马格里特,PSCBS公司,QDNAseq公司,Rsamtools软件，实用程序，S4载体，统计，爱尔兰航空公司
系统要求
统一资源定位地址
Bug报告	https://github.com/Pitithat-pu/cfdnakit/issues网站

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	cfdnakit_1.2.0.tar.gz公司
Windows二进制	cfdnakit_1.2.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	cfdnakit_1.2.0.tgz文件
macOS二进制（arm64）	cfdnakit_1.2.0.tgz文件
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cfdnakit
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/cfdnakit（包/cfdnakit）
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cfdnakit网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/cfdnakit网站/
软件包下载报告	下载统计信息