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cbp经理

生成、管理和编辑适合在cBioPortal for Cancer Genomics中导入的数据和元数据文件


生物导体版本:释放(3.19)

此R包提供了一个R Shiny应用程序,使用户能够生成、管理和编辑适合在cBioPortal for Cancer Genomics中导入的数据和元数据文件。创建癌症研究并编辑其元数据。上传患者的突变数据,这些数据将连接到研究的data_mutation_extended.txt文件中。创建和编辑临床患者数据、样本数据和时间线数据。为患者创建自定义时间线轨迹。

作者:Arsenij Ustjanzew[aut,cre,cph],费德里科·马里尼[aut]

维护人员:Arsenij Ustjanzew<Arsenij.Ustjanzew在gmail.com>

引文(从R中输入引文(“cbpManager”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“cbpManager”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“cbpManager”)
简介.html HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,数据表示,图形用户界面,免疫肿瘤学,预处理,软件,第三方客户,可视化
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 AGPL-3+文件许可证
取决于 闪亮的,闪亮的仪表板
进口 实用程序,数据传输时间,html工具,虚拟房间,普利尔,数字播放器,马格里特,jsonlite公司,说唱工具,蛇怪,网状的,闪亮BS,小贩,林特罗斯,爱尔兰航空公司,降价
系统要求
统一资源定位地址 https://arsenij-ust.github.io/cbpManager/index.html
错误报告 https://github.com/arsenij-ust/cbpManager/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 cbp经理_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 cbpManager_1.12.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) cbp管理器_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) cbp管理器_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbpManager网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/cbpManager
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/cbp管理员/
包短Url https://bioconductor.org/packages/cbpManager网站/
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