卡斯珀

基于对端读取的选择性拼接特征

生物导体版本：释放（3.19）

从配对RNA-seq数据推断选择性剪接。该模型基于外显子之间的计数路径，而不是成对的外显子连接，并以非参数方式估计片段大小和起始分布，这提高了估计精度。

作者：David Rossell、Camille Stephan Otto、Manuel Kroiss、Miranda Stobbe、Victor Pena

维护人员：大卫·罗塞尔（David Rossell）

引文（从R中输入引文（“casper”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“casper”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“casper”）

生物视图	差异表达式,基因表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件,转录
版本	2.38.0
在生物导体中	生物技术2.12（R-3.0）（11年）
许可证	GPL（>=2）
取决于	R（>=3.6.0），博科生物,I范围、方法、，基因组范围
进口	生物遗传学(>= 0.31.6),尾波,电子束阵列,嘎嘎,gtools（工具）,基因组信息Db,基因组特征,利马,mgcv公司,Rsamtools软件,rtracklayer公司,S4载体(>= 0.9.25),平方英尺,生存,VGAM公司
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	卡斯珀2.38.0.tar.gz
Windows二进制	卡斯珀2.38.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/casper网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/容器
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/casper/
包短Url	https://bioductor.org/packages/casper/
软件包下载报告	下载统计信息