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生物癌症

交互式多组癌症数据可视化与分析


生物导体版本:释放(3.19)

此软件包是一个闪亮的应用程序,用于可视化和交互式分析癌症基因组数据的多分析。

作者:卡里姆·梅周德[aut,cre]

维护人员:卡里姆·梅周德(Karim Mezhoud)<kmezhoud at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“生物癌”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“bioCancer”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“生物癌”)
生物癌症:交互式多OMICS癌症数据可视化与分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据表示,图形用户界面,基因表达式,基因目标,多重比较,网络,路径,反应途径,软件,可视化
版本 1.32.0
在生物导体中 生物C 3.4(R-3.3)(7.5年)
许可证 AGPL-3 |文件许可证
取决于 R(>=3.6.0),辐射度数据(>= 0.9.1),cBioPortalData公司,XML格式(>= 3.98)
进口 R.oo公司,R.方法S3,DT公司(>= 0.3),数字播放器(>= 0.7.2),第三年,闪亮的(>= 1.0.5),AlgDesign公司(>= 1.1.7.3),进口(>=1.1.0),方法,注释Dbi,发光体,博科生物,geNet分类器,组织Hs.eg.db,组织Bt.eg.db,剂量,clusterProfiler(群集探查器),反应.db,反应omePA,图R(<= 1.01),visNetwork(可视网络),html小部件,普利尔,易怒的,政府.db
系统要求
统一资源定位地址 https://kmezhoud.github.io/生物癌/
错误报告 https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物癌_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 bioCancer_1.32.0.zip
macOS二进制(x86_64) 生物癌_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64) 生物癌_1.32.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/生物癌症
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/bioCancer网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/bioCancer网站/
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