贝塔HMM

识别β值DNA甲基化数据不同甲基化位点和区域的隐马尔可夫模型方法

生物导体版本：释放（3.19）

一种利用齐次隐马尔可夫模型的新方法。并有效地模拟未转换的β值。在考虑空间的同时识别DMC。相邻CpG位点的相关性。

作者：科耶尔·马朱姆达尔[cre，aut]、罗米娜·席尔瓦[aut]、安托瓦内特·萨布丽娜·佩里[aut'、罗纳德·威廉·沃森[aut]、伊索贝尔·克莱尔·戈尔利[aut]，托马斯·布伦丹·墨菲，弗洛伦斯·贾夫雷齐克[aut]，安德烈亚·劳[aut]

维护人员：Koyel Majumdar在ucdconnect.ie>

引文（从R中输入引文（“betaHMM”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“betaHMM”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“betaHMM”）

生物视图	生物医学信息学,新闻报道,DNA甲基化,差异甲基化,基因目标,HiddenMarkov模型,免疫肿瘤学,甲基化阵列,微阵列,多重比较,排序,软件,空间
版本	1.0.0
在生物导体中	生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=4.3.0），摘要实验,S4载体,基因组范围
进口	统计数据，ggplot2,规模、方法、，pROC公司,foreach公司,do并行，平行，奶牛场,数字播放器,三年,潮汐选择,字符串，实用程序
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	betaHMM_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	betaHMM_1.0.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	βHMM_1.0.0.tgz
macOS二进制（arm64）	βHMM_1.0.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/betaHMM
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/betaHMM
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/betaHMM网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/betaHMM网站/
软件包下载报告	下载统计信息