河坝的
微生物数据差异丰度方法基准
生物导体版本：释放（3.19）
从微生物组数据集（具有绝对计数值的16S或WMS）开始，可以进行多次分析，以评估许多差异丰度检测方法的性能。提供了主要差异丰度分析方法的基本标准化版本，但用户也可以将其方法添加到基准中。分析主要集中在四个方面：i）每个方法对观测计数数据的分布假设的拟合优度，ii）控制错误发现率的能力，iii）方法内部和方法之间的一致性，iv）如果给出任何先验知识，则结果的真实性。有几个图形功能可用于结果可视化。
作者：马蒂奥·卡尔加罗（Matteo Calgaro）[aut，cre]
，Chiara Romualdi[aut]，戴维德·里索[aut]，尼古拉·维图洛[aut]
维护人员：马蒂奥·卡尔加罗（Matteo Calgaro）<mcalgaro93 at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“benchdamic”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“benchdamic”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“benchdamic”）
细节
| 生物视图 |
差异表达式,基因组,微生物组,多重比较,规范化,预处理,软件 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
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| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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| Bug报告 |
https://github.com/mcalgaro93/benchdamic/issues |
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程序包档案
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