阵列质量指标

微阵列数据集的质量度量报告


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet、NChannelSet、AffyBatch)中的数据生成微阵列质量指标报告。支持一个和两个彩色阵列平台。

作者:奥黛丽·考夫曼(Audrey Kauffmann)、沃尔夫冈·胡贝尔(Wolfgang Huber)

维护人员:迈克·史密斯(Mike Smith)

引文(从R中输入引文(“arrayQualityMetrics”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“arrayQualityMetrics”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“arrayQualityMetrics”)
高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理 PDF格式 R脚本
简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 微阵列,一个频道,质量控制,报告写作,软件,双通道
版本 3.60.0
在生物导体中 生物技术2.1(R-2.6)(17年)
许可证 LGPL(>=2)
取决于
进口 阿菲,affyPLM公司(>= 1.27.3),beadarray公司,博科生物,基因过滤器,图形,grDevices,网格,网格SVG(>= 1.4-3),Hmisc公司,h写入程序,晶格,额外格子,利马、方法、,R彩色啤酒,设置RNG,统计数据,实用程序,vsn(vsn)(>= 3.23.3),XML格式,斯格利特
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/grimbough/arrayQualityMetrics/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 阵列质量指标_3.60.0.tar.gz
Windows二进制 阵列质量指标_3.60.0.zip
macOS二进制(x86_64) 数组质量度量_3.60.0.tgz
macOS二进制(arm64) 数组质量指标_3.60.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayQualityMetrics
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/阵列质量指标
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/arrayQualityMetrics/
包短Url https://bioconductor.org/packages/arrayQualityMetrics网站/
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