TEKRABber公司
R包估计了两个物种之间的直系和转座元件的相关性
生物导体版本：释放（3.19）
TEKRABber是为了提供一个用户友好的管道，用于比较两个物种之间的直系和转座元件（TE）。它考虑了来自BioMart的两个物种之间的直系置信度，以标准化表达计数并检测差异表达的直系基因/TE。然后对所需的正交和TE进行一对一的相关分析。还有一个应用程序功能可以对结果进行初步了解。用户可以根据自己的偏好，按照渐晕图中提到的数据结构运行TEKRABber，来准备正交/TEs RNA-seq表达数据。
作者：陈耀昌[aut，cre]
，卡蒂娅·诺威克[aut]
维护人员：陈耀聪（Yao-Chung Chen）<fu-berlin.de>
引文（从R中输入引文（“TEKRABber”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“TEKRABber”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“TEKRABber”）
细节
| 生物视图 |
差异表达式,基因表达式,规范化,软件,转录 |
| 版本 |
1.8.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.15（R-4.2）（2.5年） |
| 许可证 |
LGPL（>=3） |
| 取决于 |
R（>=4.3） |
| 进口 |
apeglm公司,生物反应器,数字播放器,do并行,设计2,foreach公司,基因组信息Db,马格里特,卢比(>= 1.0.7),rtracklayer公司,SCBN公司，统计，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/ferygood/TEKRABber网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/ferygood/TEKRABber/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
