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基于TD的UFE

基于张量分解的无监督特征提取


生物导体版本:释放(3.19)

这是一个全面的软件包,用于执行基于张量分解的无监督特征提取。它可以执行无监督的特征提取。它使用张量分解。它适用于基因表达、DNA甲基化、组蛋白修饰等,可以进行多组学分析。它也可能适用于单细胞组学数据集。

作者:Y-h.田口[aut,cre]

维护人员:Y-h.田口<tag-at-granular.com>

引文(从R中输入引文(“TDbasedUFE”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“TDbasedUFE”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“基于TD的UFE”)
快速启动 HTML格式 R脚本
基于TD的UFE HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 特征提取,基因表达式,甲基化阵列,单个单元格,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 生物柴油3.17(R-4.3)(1年)
许可证 GPL-3公司
取决于
进口 基因组范围,r张量,读数器、方法、,MOFAdata公司,tximport(最大端口),tximportData(最大端口数据),图形,统计,实用程序,闪亮的
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/tagtag/TDbasedUFE网站
错误报告 https://github.com/tagtag/TDbasedUFE/问题
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建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个(>= 3.0.0)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 基于TD的UFE_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 基于TD的UFE_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64) 基于TD的UFE_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) 基于时间的UFE_1.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TDbasedUFE
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/TDbasedUFE
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/TDbasedUFE网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/TDbasedUFE网站/
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