冲浪者
表面蛋白预测与鉴定
生物导体版本：释放（3.19）
从候选基因列表中识别表面蛋白编码基因。系统地从GEO和TCGA下载数据或使用您自己的数据。对批量RNAseq数据执行DGE。进行荟萃分析。描述性富集分析和绘图。
作者：奥罗拉·毛里齐奥[aut，cre]
，安娜·索菲亚·塔西尼[aut，ctb]
维护人员：Aurora Maurizio<auroramaurizio1 at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“SurfR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“冲浪者”）
细节
| 生物视图 |
BatchEffect（批次效果）,数据导入,差异表达式,功能基因组学,功能预测,GO（开始）,基因表达式,基因预测,GeneSet扩展,路径,主要组件,RNA序列,排序,软件,转录,可视化 |
| 版本 |
1.0.0 |
| 在生物导体中 |
生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
GPL-3+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
高温气冷堆,生物文件缓存,仿生风格,SPsimSeq软件,设计2,边缘R,开放式xlsx,字符串,rhdf5型,ggplot2,gg排斥，统计，马格里特,资产占有人,第三年,数字播放器,TCG生物链,生物反应器,metaRNA序列,丰富R,规模,文恩,额外网格,总结性实验,针织物，grDevices，图形，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/auroramaurizio/SurfR |
| 错误报告 |
https://github.com/auroramaurizio/SurfR/issues |
查看更多
| 建议 |
测试那个(>= 3.0.0) |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 链接到我 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
