汇总

摘要2：一套估计、调整和利用遗传总结数据中子结构的方法

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包包含Summix2方法，用于估计和调整遗传汇总等位基因频率数据中的子结构。函数summix（）使用混合模型估计参考组比例。adjAF（）函数为观察组生成调整后的等位基因频率，参考组比例与目标个体或样本匹配。summix_local（）函数估计本地祖先混合比例，并在遗传摘要数据中执行选择扫描。

作者：奥黛丽·亨德里克斯（Audrey Hendricks）[cre]，普莱斯·阿德勒（Price Adelle）[aut]，斯通曼·海利（Stoneman Haley）[aut]

维护人员：奥黛丽·亨德里克斯

引文（从R中输入引文（“摘要”）)以下为：

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“Summix”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“摘要”）

Summix.html（摘要.html）	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	遗传学,软件,统计方法,全基因组
版本	2.10.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.3）
进口	数字播放器,nloptr公司,马格里特，方法，易怒的,潮汐选择,贝达斯利,规模,visNetwork（可视网络）,随机coloR
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/Bioconductor/Summix/issues网站

建议	rmarkdown公司,降价,针织者,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	汇总_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	总结_2.10.0.zip
macOS二进制（x86_64）	汇总_2.10.0.tgz
macOS二进制（arm64）	汇总_2.10.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Summix网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/摘要
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Summix网站/
包短Url	https://bioductor.org/packages/sumix/
软件包下载报告	下载统计信息