单分子足迹
单分子足迹（SMF）数据分析工具
生物导体版本：释放（3.19）
单分子足迹是一个R包，提供分析单分子足迹（SMF）数据的功能。按照其小插曲中举例说明的工作流程，用户将能够以最小的编码工作量对SMF数据进行基本数据分析。从对齐的bam文件开始，我们展示了如何对测序库进行质量控制，在单分子水平提取甲基化信息，以解释两种可能的SMF实验（单酶或双酶），根据分子占据模式对单分子进行分类，在给定的基因组位置绘制SMF信息
作者：吉多·巴尔扎吉[aut，cre]
，阿诺·克雷布斯[aut]，迈克·史密斯
维护人员：吉多·巴尔扎吉（Guido Barzaghi）<Guido.Barzaghi at embl.de>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“单分子足迹”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
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细节
| 生物视图 |
新闻报道,DNA甲基化,数据表示,表观遗传学,甲基Seq,核小体定位,质量控制,软件 |
| 版本 |
1.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.13（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
GPL-3型 |
| 取决于 |
R（>=4.1.0） |
| 进口 |
生物遗传学,生物串,牛基因组,基因组信息Db,基因组范围,数据表，gr设备，普利尔,I范围,R彩色啤酒，统计，QuasR公司 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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| 错误报告 |
https://github.com/Krebslabrep/SingleMoleculeFootprinting/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
