屏幕R

进行高通量生物筛选的包装

生物导体版本：释放（3.19）

ScreenR是一个适合在功能丧失时执行命中识别的软件包。高通量生物筛选使用基于条形码的shRNA库执行。ScreenR将edgeR等软件的计算能力与Tidyverse元包的简单使用结合在一起。ScreenR执行一个管道，能够从条形码计数中找到候选点击，并为分析的每个步骤集成了广泛的可视化模式。

作者：伊曼纽尔·米歇尔·索达[aut，cre]（0000-0002-2301-6465），埃琳娜·塞卡奇[aut]（00000-0002-2285-8994），萨维里奥·米努奇[fnd，ths]（0000-1-5678-536X）

维护人员：伊曼纽尔·米歇尔·索达（Emanuel Michele Soda）

引文（从R中输入引文（“ScreenR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“ScreenR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“屏幕R”）

生物视图	分析域,基因表达式,软件
版本	1.6.0
在生物导体中	生物柴油3.16（R-4.2）（1.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.2）
进口	方法（>=4.0），rlang（>=0.4），stringr（>=1.4），利马（>=3.46），拼接（>=1.1），可移动（>=3.1.6），刻度（>=1.1.1），ggvenn（>=0.1.9），purr（>=0.3.4），ggplot2（>=3.3），统计，tidyr（>=1.2），magrittr（>=1.0），dplyr（>=1.0），边缘R（>=3.32），tidyselect（>=1.1.2）
系统要求
统一资源定位地址	https://emanuelsda.github.io/ScreenR/
错误报告	https://github.com/EmanuelSoda/ScreenR/issues网站

建议	rmarkdown（>=2.11），knitr（>=1.37），testtat（>=3.0.0），仿生风格（>=2.22.0），covr（>=3.5）
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	屏幕R_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	屏幕R_1.6.0.zip
macOS二进制（x86_64）	屏幕R_1.6.0.tgz
macOS二进制（arm64）	屏幕R_1.6.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ScreenR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/屏幕R
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ScreenR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/ScreenR/
软件包下载报告	下载统计信息