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SCFA公司

SCFA:通过共识因子分析进行分型


生物导体版本:释放(3.19)

通过一致性因子分析(SCFA)进行分型可以有效地去除多组分数据中一致分子模式中的噪声信号。SCFA首先使用自动编码器只选择重要特征,然后重复执行因子分析,以表示具有不同数量因子的数据。利用这些表征,它可以可靠地识别癌症亚型并准确预测患者的风险评分。

作者:Duc Tran[aut,cre],Hung Nguyen[aut],Tin Nguyen[fnd]

维护人员:Duc Tran<内华达州管道.unr.edu>

引文(从R中输入引文(“SCFA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SCFA”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“SCFA”)
SCFA包手册 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分类,群集,软件,生存
版本 1.14.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 LGPL公司
取决于 R(>=4.0)
进口 矩阵统计,生物并行,火炬(>= 0.3.0),科罗,记录仪,矩阵,集群,心理,格尔姆奈特,RhpcBLASctl公司,统计信息,实用工具,方法,生存
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/导管317/SCFA
错误报告 https://github.com/duct317/SCFA/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 SCFA_1.14.0.tar.gz公司
Windows二进制 SCFA_1.14.0.zip系列(仅64位)
macOS二进制(x86_64) SCFA_1.14.0.tgz标准立方英尺
macOS二进制(arm64) SCFA_1.14.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCFA网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/SCFA
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SCFA网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SCFA网站/
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