Rn珠子
Rn珠子
生物导体版本：释放（3.19）
RnBeds有助于在基因组规模上对各种类型的DNA甲基化数据进行全面分析。
作者：亚森·阿塞诺夫[aut]、克里斯托夫·博克[aut]:Pavlo Lutsik[aut:]、迈克尔·谢勒[aut:]、费边·米勒[aut，cre]
维护人员：Fabian Mueller<rnbeads.org团队>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“RnBeads”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“RnBeads”）
细节
| 生物视图 |
BatchEffect（批次效果）,CpGIsland公司,DNA甲基化,数据导入,差异甲基化,表观遗传学,免疫肿瘤学,甲基Seq,甲基化阵列,预处理,质量控制,排序,软件,双通道 |
| 版本 |
2.22.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.1（R-3.2）（9年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=3.0.0），生物遗传学,S4载体(>= 0.9.25),基因组范围,MASS（质量）,集群,ff（关闭）,领域,ggplot2(>= 0.9.2),gplots（gplots），网格，额外网格,利马,矩阵统计、方法、，照明,甲基脲,普利尔 |
| 进口 |
I范围 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
| 建议 |
类别,GOstats公司,Gviz公司,IlluminaHumanMethylation450k最佳,RPMM公司,Rn珠子.hg19,Rn珠子.mm9,Rn珠子.hg38,XML格式,注释,生物电阻,foreach公司,do并行,ggbio公司,伊斯瓦,麦克卢斯特,mgcv公司,米菲,国家实验室,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,组织Rn.eg.db,二次规划优化函数,rtracklayer公司,q值,特别行政区,瓦特瓜,文字云,q值,参数解析,格尔姆奈特,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19公司,规模,甲基错误,插补,闪亮的,闪耀（shinyjs）,倍体,己糖,RUnit（运行单位）,甲基寻求者,芝麻 |
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
MAGAR公司 |
| 导入我 |
|
| 建议我 |
Rn珠子.hg19,Rn珠子.hg38,Rn水头/mm10,Rn珠子.mm9,Rn珠子.rn5 |
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
