报告工具
用于制作各种格式报告的工具
生物导体版本：释放（3.19）
ReportingTools软件包使用户能够轻松显示从微阵列和测序数据等来源生成的分析结果报告。该软件包允许用户创建HTML页面，这些页面可以在Safari等web浏览器上查看，也可以在Excel等程序可读的其他格式中查看。用户可以生成具有可排序和可筛选列的表，绘制和显示绘图，并将表条目链接到其他数据源，如NCBI或HTML页面中的更大绘图。使用该包，用户还可以生成一个目录页面，将特定项目的各种报告链接在一起，这些报告可以在web浏览器中查看。有关更多示例，请访问我们的网站：http://research-pub.gene.com/ReportingTools。
作者：杰森·哈克尼（Jason A.Hackney）、梅兰妮·亨特利（Melanie Huntley
维护人员：杰森·哈克尼（Jason A.Hackney）<Hackney.Jason at gene.com>，加布里埃尔·贝克尔（Gabriel Becker）<Becker.gabe at gene.com/>，杰西卡·拉尔森（Jessica L.Larson）<Larson.Jessica at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“ReportingTools”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“ReportingTools”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“报告工具”）
细节
| 生物视图 |
数据表示,GO（开始）,GeneSet扩展,免疫肿瘤学,微阵列,RNA序列,软件,可视化 |
| 版本 |
2.44.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术2.11（R-2.15）（11.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
方法，针织物，实用程序 |
| 进口 |
博科生物,h写入程序,类别,GOstats公司,利马(>= 3.17.5),晶格,注释Dbi,边缘R,注释,PFAM.db型,GSEA基础,生物遗传学（>=0.1.6），网格，XML格式,R.utils公司,DESeq2公司(>= 1.3.41),ggplot2,ggbio公司,I范围 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
| 建议 |
RUnit（运行单位）,所有,hgu95av2.db型,组织管理例会.db,闪亮的,帕西拉,组织S.c.sgd.db,rmarkdown公司,降价 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
附加核心工具 |
| 建议我 |
扩展浏览器,GSEA基础,cpvSNP公司,npGSEA公司 |
| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
