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反应物内容服务4R

Reactome内容服务接口


生物导体版本:释放(3.19)

Reactome是一个免费、开源、开放获取、策划和同行评审的生物分子途径知识库。此包将与Reactome Content Service API交互。预先构建的功能将允许用户检索由蛋白质、通路和其他与Reactome中特定基因或实体相关的分子组成的数据和图像。

作者:池兰庞[aut,cre],反应体[cph]

维护人员:Chi-Lam Poon<clpoon807,网址:gmail.com>

引文(从R中输入引文(“ReactomeContentService4R”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ReactomeContentService4R”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ReactomeContentService4R”)
反应物内容服务4R HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,路径,反应途径,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 Apache许可证(>=2.0)|文件许可证
取决于
进口 高温气冷堆,jsonlite公司,实用程序,魔法(>= 2.5.1),数据表,do并行,foreach公司,并行
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/reactome/RectomeContentService4R
错误报告 https://github.com/reactome/ReatomeContentService4R/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 反应物内容服务4R_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 反应物内容服务4R_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 反应物内容物服务4R_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 反应物内容物服务4R_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ReactomeContentService4R
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ReactomeContentService4R
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ReatomeContentService4R/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ReactomeContentService4R/
软件包下载报告 下载统计信息