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魁北克省

Rbec:一种分析合成微生物群落amplicon测序数据的工具


生物导体版本:释放(3.19)

Rbec是DADA2的一个改进版本,用于分析合成群体(SynComs)的扩增子序列数据,其中每个菌株都有参考序列。Rbec不仅可以准确地描述SynCom中的微生物成分,而且可以预测SynCom样品中的污染物。

作者:张鹏凡[aut,cre]

维护人员:张鹏凡<mpipz.mpg.de>

引文(从R中输入引文(“Rbec”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“Rbec”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“Rbec”)
魁北克省 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 微生物菌株,微生物组,排序,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 LGPL-3型
取决于
进口 卢比(>= 1.0.6),数据2,ggplot2,读数器,do并行,foreach公司、grDevices、stats、utils
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 Rbec_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 Rbec_1.12.0.zip卢比
macOS二进制(x86_64) 雷贝克_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbec
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/Rbec
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Rbec网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/Rbec/
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