Q实用程序

准物种多样性

生物导体版本：发布（3.19）

利用NGS数据进行病毒准种分析的效用函数集。大多数功能对宏基因组研究同样有用。主要有三种类型：（1）数据操作和探索功能，用于将读取转换为单倍型和频率、修复读取、交叉链单倍型以及可视化单倍型比对。（2）多样性指数-计算多样性和熵的函数，其中考虑了关联度、丰度和功能指数。（3）数据模拟-用于生成随机病毒准种数据的功能。

作者：梅赛德斯·格雷罗·莫里洛[cre，aut]，Josep Gregori i字体[aut]

维护人员：梅赛德斯·格雷罗·莫里洛（Mercedes Guerrero-Murillo）

引文（从R中输入引文（“QSutils”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“QSutils”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“QSutils”）

QSUtils-校准	HTML格式	R脚本
QSutils多样性	HTML格式	R脚本
QSutils模拟	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	对齐,DNASeq公司,数据导入,遗传变异性,遗传学,序列匹配,排序,软件
版本	1.22.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（5.5年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=3.5），生物串,pwalling（pwallign）,生物遗传学，方法
进口	猿，统计，心理
系统要求
统一资源定位地址

建议	仿生风格、knitr、rmarkdown、ggplot2
链接到
增强
取决于我
导入我	长readvqs
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	QSutils_1.22.0.tar.gz（QSutils _ 1.22.0.tar）
Windows二进制	QSutils_1.22.0.zip文件（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	QSutils_1.22.0.tgz
macOS二进制（arm64）	QSutils_1.22.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QSutils网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：程序包/Q实用程序
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/QSutils网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/QSutils网站/
软件包下载报告	下载统计信息