ProteoDisco公司
根据基因组变体、剪接连接和人工序列生成定制的蛋白质变体数据库
生物导体版本：释放（3.19）
ProteoDisco是一个R包，用于促进蛋白质组学研究。它具有根据用户提交的基因组变体、剪接连接、融合基因和手动转录序列创建定制（变体）蛋白质数据库的功能。灵活的工作流程可用于各种研究和实验设置。
作者：约伯·范·里特[cre]、韦斯利·范德格尔[aut]、哈蒙·范德维尔肯[ths]
维护人员：Job van Riet<gmail.com上的jobvriet>
引文（从R中输入引文（“ProteoDisco”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“ProteoDisco”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“ProteoDisco”）
细节
| 生物视图 |
数据导入,蛋白质组学,RNA序列,SNP公司,排序,软件,变量注释 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（2.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.1.0） |
| 进口 |
生物遗传学(>= 0.38.0),生物并行(>= 1.26.0),生物串（>=2.60.1），将死（>=2.0.0），切割器(>= 1.30.0),数字播放器(>= 1.0.6),基因组信息Db(>= 1.28.0),基因组特征(>= 1.44.0),基因组范围(>= 1.44.0),I范围（>=2.26.0）、方法（>=4.1.0），并行记录器(>= 2.0.1),普利尔(>= 1.8.6),爱尔兰航空公司(>= 0.4.11),S4载体(>= 0.30.0),易怒的(>= 3.1.2),第三年(>= 1.1.3),变量注释(>= 1.36.0),十六矢量（>=0.32.0） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/ErasmusMC-CCBC/ProteoDisco |
| 错误报告 |
https://github.com/ErasmusMC-CCBC/ProteoDisco/issues |
查看更多
| 建议 |
注释Dbi(>= 1.54.1),牛基因组(>= 1.60.0),英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19(>= 1.4.3),仿生风格(>= 2.20.1),DelayedArray（延迟阵列）(>= 0.18.0),开发工具(>= 2.4.2),针织物(>= 1.33),矩阵统计(>= 0.59.0),降价(>= 1.1),组织Hs.eg.db(>= 3.13.0),呜呜声(>= 0.3.4),RCurl（RCurl）(>= 1.98.1.3),阅读器（>=1.4.0），ggplot2(>= 3.3.5),市场营销（>=2.9），rtracklayer公司(>= 1.52.0),顺序(>= 4.2.8),字符串（>=1.4.0），重塑2(>= 1.4.4),规模(>= 1.1.1),测试那个(>= 3.0.3),TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19已知基因(>= 3.2.2) |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
