PoD呼叫
DNA甲基化液滴数字PCR的阳性液滴呼唤
生物导体版本：释放（3.19）
读取从“QX Manager或QuantaSoft”导出的文件，其中包含运行ddPCR（96孔板）时的振幅值，并稳健设置阈值，以确定每个井的每个通道的正液滴。然后计算每个井的浓度和归一化浓度以及其他指标。结果以表格的形式返回，可以选择写入文件，也可以选择每个写入文件的通道的绘图（散点图和直方图）。该软件包包括一个闪亮的应用程序，为PoDCall的全部功能提供了一个交互式和用户友好的界面。
作者：Hans Petter Brodal[aut，cre]，Marine Jeanmougin[aut]，Guro Elisabeth Lind[aut]
维护人员：Hans Petter Brodal<Hans.Petter.Brodal at rr-research.no>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“PoDCall”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“PoDCall”）
细节
| 生物视图 |
分类,CpGIsland公司,DNA甲基化,差异甲基化,表观遗传学,软件,ddPCR |
| 版本 |
1.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.13（R-4.1）（3.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.4） |
| 进口 |
ggplot2,额外网格,麦克卢斯特,浸入试验,rlist公司,闪亮的,DT公司,Laplaces恶魔,呜呜声,闪耀（shinyjs）,阅读器、grDevices、stats、utils |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
