PhIP数据

PhIP序列实验容器

生物导体版本：释放（3.19）

PhIPData为噬菌体免疫沉淀测序（PhIP-seq）实验定义了S4类。PhIPData基于RangedSummarizedExperiment类构建，使用户能够在分析中协调元数据与实验数据。此外，PhIPData提供了专门的方法来子集和识别只含珠子的样本，使用病毒别名子集对象，并使用现有的肽库填充对象参数。

作者：陈雅典娜[aut，cre]，Rob Scharpf[aut]，Ingo Ruczinski[aut]

维护人员：陈雅典娜（Athena Chen）<jhu.edu的achen70

引文（从R中输入引文（“PhIPData”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“PhIPData”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“PhIPData”）

PhIPData：PhIP-Seq实验的容器	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	新闻报道,数据表示,基础设施,排序,软件
版本	1.12.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.1.0），总结性实验(>= 1.3.81)
进口	生物文件缓存,生物遗传学、方法、，基因组范围,I范围,S4载体,边缘R,克莱，实用程序
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/athchen/PhIPData/issues

建议	仿生风格,测试那个,针织物,rmarkdown公司,覆盖（covr）,数字播放器,阅读器,用r
链接到
增强功能
取决于我	啤酒
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	PhIP数据_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	PhIPData_1.12.0.zip
macOS二进制（x86_64）	PhIP数据_1.12.0.tgz
macOS二进制（arm64）	PhIP数据_1.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PhIPData网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/PhIPData
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/PhIPData网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/PhIPData/
软件包下载报告	下载统计信息