潘维兹

将多麦克风网络数据与总结级GWAS数据集成


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包将来自《京都基因和基因组百科全书》(KEGG)的数据与摘要级全基因组关联(GWAS)数据(如GWAS目录或GWAS中央数据库或用户自己的研究或数据集提供的数据)相结合,以生成称为IMON(集成多微网络)的生物网络。IMON可用于分析生化和代谢反应网络背景下的trat-specific多态性数据,为GWAS数据提供更大的生物学解释性。

作者:卢卡·安霍尔特[cre,aut]

维护人员:卢卡·安霍尔特(Luca Anholt)<la1317 at ic.ac.uk>

引文(从R中输入引文(“PanViz”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“PanViz”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignets(“PanViz”)
潘维兹 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 基因组广泛协会,图形和网络,KEGG公司,代谢组学,网络,反应途径,SNP公司,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 生物柴油3.16(R-4.2)(2年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.2.0)
进口 第三年,字符串,数字播放器,易怒的,马格里特,无用的日志,实用程序,easycsv公司,伦特斯,记录仪,R彩色啤酒,数据表,色彩空间,gr设备,爱尔兰航空公司,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/LucaAnholt/PanViz
Bug报告 https://github.com/LucaAnholt/PanViz/issues网站
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建议 测试那个(>= 3.0.0),生物风格,针织物,rmarkdown公司,网络D3
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 潘维兹_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 PanViz_1.6.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 全景_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) 潘维兹_1.6.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PanViz
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/PanViz
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/PanViz/
包短Url https://bioconductor.org/packages/PanViz/
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