POMA公司
Omics数据分析工具
生物导体版本：释放（3.19）
POMA包提供了一个用于组学数据分析的综合工具包，简化了从初始可视化到最终统计分析的过程。其主要目标是简化和统一组学数据处理中涉及的各个步骤，使其在单个直观的R包中更容易访问和管理。POMA强调再现性和用户友好性，利用Bioconductor的标准化SummarizedExperiment类，确保与多种Biocondulator工具无缝集成和兼容。这种方法保证了最大的灵活性和可复制性，使POMA成为处理组学数据集的研究人员的重要资产。请参见https://github.com/pcastellanoescuder/POMAShiny。论文：Castellano-Escuder等人（2021）了解更多详细信息。
作者：波尔·卡斯特拉诺·埃斯库德[aut，cre]
维护人员：波尔·卡斯特兰诺·埃斯库德（Pol Castellano-Escuder）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“POMA”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“POMA”）
细节
| 生物视图 |
BatchEffect（批次效果）,分类,群集,决策树,尺寸缩减,多维缩放,规范化,预处理,主要组件,RNA序列,回归,软件,统计方法,可视化 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（4年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.0） |
| 进口 |
扫帚,插入符号,复杂热图,聚类算法,数字播放器,DESeq2公司,金融服务管理局,ggplot2,gg排斥,格尔姆奈特,插补,看门人,利马,lme4公司,马格里特,MASS（质量）,mixOmics公司,随机森林,RankProd公司(>= 3.14),爱尔兰航空公司,总结性实验,特别行政区,易怒的,第三年，实用程序，超高速,素食主义者 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/pcastellanoescuder/POMA网站 |
| Bug报告 |
https://github.com/pcastellanoescuder/POMA/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
