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有机体.dplyr

基于dplyr的生物导体注释资源访问


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包为Bioconductor“注释”资源提供了一个替代接口,尤其是“org”软件包(例如org.Hs.eg.db)的基因标识符映射功能和“TxDb”软件包的基因组协调功能(例如TxDb.Hsapens.UCSC.hg38.knownGene)。

作者:马丁·摩根(aut,cre)、丹尼尔·范·特维斯克(Daniel van Twisk)、郑玉波(Yubo Cheng)

维护人员:马丁·摩根(Martin Morgan)<Martin.morg at roswellpark.org>

引文(从R中输入引文(“Organism.dplyr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“Organism.dplyr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“Organism.dplyr”)
有机体.dplyr HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释,基因组注释,排序,软件
版本 1.32.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.4),数字播放器(>= 0.7.0),批注筛选器(>= 1.1.3)
进口 RSQ网站,S4载体,基因组信息数据库,I范围,基因组范围,基因组特征,注释Dbi,爱尔兰航空公司、方法、工具、实用程序,生物文件缓存,数据库接口,dbplyr公司,易怒的
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/Bioconductor/Organism.dplyr/issues网站
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建议 组织Hs.eg.db,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,组织管理例会.db,TxDb(发送日期)。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.ensGene公司,测试那个,针织物,rmarkdown公司,魔法,仿生风格,ggplot2
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 有机体.dplyr_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 有机体.dplyr_1.32.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 生物体dplyr_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64) 有机体.dplyr_1.32.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Organism.dplyr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Organis.dplyr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Organism.dplyr/
包短Url https://bioconductor.org/packages/Organism.dplyr/
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