有机体.dplyr
基于dplyr的生物导体注释资源访问
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包为Bioconductor“注释”资源提供了一个替代接口,尤其是“org”软件包(例如org.Hs.eg.db)的基因标识符映射功能和“TxDb”软件包的基因组协调功能(例如TxDb.Hsapens.UCSC.hg38.knownGene)。
作者:马丁·摩根(aut,cre)、丹尼尔·范·特维斯克(Daniel van Twisk)、郑玉波(Yubo Cheng)
维护人员:马丁·摩根(Martin Morgan)<Martin.morg at roswellpark.org>
引文(从R中输入引文(“Organism.dplyr”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“Organism.dplyr”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“Organism.dplyr”)
细节
生物视图 |
注释,基因组注释,排序,软件 |
版本 |
1.32.0 |
在生物导体中 |
生物活性炭3.5(R-3.4)(7年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.4),数字播放器(>= 0.7.0),批注筛选器(>= 1.1.3) |
进口 |
RSQ网站,S4载体,基因组信息数据库,I范围,基因组范围,基因组特征,注释Dbi,爱尔兰航空公司、方法、工具、实用程序,生物文件缓存,数据库接口,dbplyr公司,易怒的 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/Bioconductor/Organism.dplyr/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。