标准分析仪DE

标准化方法的评估和微分表达式分析统计的计算

生物导体版本：释放（3.19）

NormalyzerDE为基于LC-MS的表达数据提供了归一化方法的筛选。它使用现有方法和新的时间分段方法计算一系列标准化矩阵，计算性能度量并生成评估报告。此外，它为基于Limma或ANOVA的差异表达分析提供了一个简单的实用程序。

作者：雅各布·威尔福斯

维护人员：雅各布·威尔福斯（Jakob Willforss）<Jakob.Willforss at hotmail.com>

引文（从R中输入引文（“NormalyzerDE”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“NormalyzerDE”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“NormalyzerDE”）

使用NormalyzerDE的差异表达和对抗技术偏见	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

生物视图	贝叶斯主义者，差异表达式，代谢组学，多重比较，规范化，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.22.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（5.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.1.0）
进口	vsn（vsn），预处理核心，利马，MASS，ape，car，ggplot2，方法，博科生物，实用程序，统计信息，总结性实验、矩阵统计、ggforce
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/ComputationalProteomics/NormalyzerDE（计算蛋白质组学）

建议	knitr、testtat、rmarkdown、roxygen2、hexpin、，仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	标准分析仪DE_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	标准分析仪DE_1.22.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	标准分析仪DE_1.22.0.tgz
macOS二进制（arm64）	标准分析仪DE_1.22.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NormalyzerDE网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/NormalyzerDE
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/NormalyzerDE网站/
程序包短Url	https://bioconductor.org/packages/NormalyzerDE网站/
软件包下载报告	下载统计信息