NetSAM公司
网络系列化和模块化
生物导体版本：释放（3.19）
NetSAM（网络序列化和模块化）软件包将加权或未加权网络的边缘列表表示作为输入，执行网络序列化和模型化分析，并生成可用作一维网络可视化工具NetGestalt输入的文件(网址：http://www.netgestalt.org)或其他网络分析。NetSAM包还可以基于输入矩阵数据生成相关网络（例如，共表达网络），对相关网络进行序列化和模块化分析，计算样本特征和模块之间的关联，或识别模块的关联GO项。
作者：Jing Wang<bcm.edu的Jing.Wang>
维护人员：时志浩<gmail.com>
引文（从R中输入引文（“NetSAM”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“NetSAM”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“NetSAM”）
细节
| 生物视图 |
软件 |
| 版本 |
1.44.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术2.13（R-3.0）（10.5年） |
| 许可证 |
LGPL公司 |
| 取决于 |
R（>=3.0.0），系列化(>= 1.0-6),记录仪（>=2.0.0），工具（>=3.0.0），WGCNA公司(>= 1.34.0),生物反应器(>= 2.18.0) |
| 进口 |
方法，注释Dbi(>= 1.28.0),do并行（>=1.0.10），foreach公司（>=1.4.0），生存(>= 2.37-7),政府.db(>= 2.10.0),R2HTML(>= 2.2.0),数据库接口（>=0.5-1） |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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查看更多
| 建议 |
RUnit（运行单位）,生物遗传学,组织S.c.sgd.db,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,组织Rn.eg.db,组织博士eg.db,组织机构代码.db,组织Cf.eg.db,组织Dm.eg.db,组织地址.db,市场营销,针织物,降价 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
