纳米MethViz
可视化牛津纳米孔测序的甲基化数据
生物导体版本：释放（3.19）
NanoMethViz是一个用于可视化牛津纳米孔测序甲基化数据的工具包。它可以用于探索从牛津纳米孔直接DNA测序获得的读取数据中的甲基化模式，其中甲基化被包括纳米抛光剂、f5c和兆氯酮在内的呼叫者调用。该软件包中的绘图允许可视化实验组和不同类别基因组特征中聚集的甲基化特征。
作者：Shian Su[创作，创作]
维护人员：Shian Su<Su.s at wehi.edu.au>
引文（从R中输入引文（“NanoMethViz”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“NanoMethViz”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“NanoMethViz”）
细节
| 生物视图 |
DNA甲基化,数据导入,差异甲基化,表观遗传学,长读,软件,可视化 |
| 版本 |
3.0.2 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年） |
| 许可证 |
Apache许可证（>=2.0） |
| 取决于 |
R（>=4.0.0），方法，ggplot2(>= 3.4.0) |
| 进口 |
第11页(>= 0.2.5),阅读器,克莱,S4载体,总结性实验,BiocSingular公司,bsseq公司,对于猫,断言,注释Dbi,卢比,数字播放器,数据表,聚类算法,e1071号,英尺,基因组范围,生物串,ggrastr公司,胶、图形、，I范围,利马(>= 3.44.0),拼凑,呜呜声,爱尔兰航空公司,R.utils公司,Rsamtools软件,规模(>= 1.2.0),科学技术委员会，统计，字符串,易怒的,第三年，实用程序，用r,zlibbico公司 |
| 系统要求 |
C++20语言 |
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/shians/NanoMethViz |
| 错误报告 |
https://github.com/Shians/NanoMethViz/issues公司 |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,决策支持系统,穆斯库卢斯(>= 1.3.1),猿人(>= 1.3.1),组织Hs.eg.db,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19已知基因,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,组织管理例会.db,TxDb（发送日期）。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.known基因,TxDb（发送日期）。姆穆苏卢斯。UCSC.mm39.ref基因,针织物,市场营销,rtracklayer公司,测试那个(>= 3.0.0),覆盖（covr） |
| 链接到 |
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生成报告 |
程序包档案
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