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MineICA公司

基因组学数据的ICA分解分析


生物导体版本:释放(3.19)

MineICA的目标是对多个转录组数据集执行独立成分分析(ICA),整合额外数据(例如分子、临床和病理学数据)。这种综合ICA通过研究成分与变量(例如样本注释)和基因集的关联,帮助对成分进行生物学解释,并使用基于相关性的图对不同数据集的成分进行比较。

作者:安妮·比顿

维护人员:安妮·比顿(Anne Biton)<Anne.Biton at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“MineICA”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MineICA”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MineICA”)
MineICA:基因组数据的独立成分分析 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 多重比较,软件,可视化
版本 1.44.0
在生物导体中 生物技术2.12(R-3.0)(11年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=2.10),方法,生物遗传学(>= 0.13.8),博科生物,普利尔,ggplot2,规模,foreach公司,xtable的,生物反应器,gtools(工具),GOstats公司,群集,结婚,麦克卢斯特,R彩色啤酒,色彩空间,记录仪,Rgraphviz公司,图表,注释,Hmisc公司,fastICA(快速ICA),
进口 注释Dbi,卢米,消防车,lumi全人类.db
系统要求
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建议 生物反应器,GOstats公司,群集,hgu133a.db公司,麦克卢斯特,记录仪,乳腺癌MAINZ,乳腺癌移植,乳腺癌UPP,乳腺癌VDX,未来,未来应用程序
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增强功能 doMC(美国国防部长办公室)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MineICA_1.44.0.tar.gz公司
Windows二进制 MineICA_1.44.0.zip公司
macOS二进制(x86_64) MineICA_1.44.0.tgz公司
macOS二进制(arm64) MineICA_1.44.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MineICA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/MineICA
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MineICA网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MineICA/
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