微生物剖面仪
用于微生物功能富集分析的R/闪亮软件包
生物导体版本：释放（3.19）
这是一个R/闪亮软件包，用于对微生物组数据进行功能富集分析。此包基于clusterProfiler。此外，MicrobiomeProfiler支持KEGG富集分析、COG富集分析，Microbe-Disease关联富集分析，Metabo-Pathway分析。
作者：Guangchuang Yu【aut，ths】广创宇【aut，ths】
，陈美君[aut，cre]
维护人员：陈美君（Meijun Chen）<mjchen1996在outlook.com>上
引文（从R中输入引文（“MicrobiomeProfiler”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“MicrobiomeProfiler”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“微生物剖析器”）
细节
| 生物视图 |
KEGG公司,微生物组,软件,可视化 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
GPL-2基因 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0） |
| 进口 |
clusterProfiler（群集探查器）(>= 4.5.2),配置,DT公司,浓缩图,傀儡,格森、方法、，马格里特,闪亮的(>= 1.6.0),闪亮小工具,闪光自定义加载器,html工具,ggplot2，图形，统计，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/YuLab-SMU/微生物档案器/ |
| 错误报告 |
https://github.com/YuLab-SMU/微生物档案器/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
