元邻居

单细胞可复制性分析


生物导体版本:释放(3.19)

MetaNeighbor允许用户使用邻居投票来量化跨数据集的单元类型可复制性。

作者:梅根·克劳【aut,cre】,萨拉·巴卢兹【ctb】,曼丹·沙阿【ctb),斯蒂芬·菲舍尔【ctb’,杰西·吉利斯【aut】

维护人员:Stephan Fischer<cshl.edu的Fischer>

引文(从R中输入引文(“MetaNeighbor”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MetaNeighbor”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“元邻居”)
MetaNeighbor用户指南 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 GO(开始),基因表达式,免疫肿瘤学,多重比较,单个单元格,软件,转录组学
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=3.5)
进口 grDevices(设备)、graphics(图形)、methods(方法)、stats(统计)(>=3.4)、utils(实用程序)(>=3.4),矩阵(>= 1.2),矩阵统计(>= 0.54),豆瓣(>= 1.2),gplots(gplots)(>= 3.0.1),R彩色啤酒(>= 1.1.2),总结性实验(>= 1.12),单细胞实验,记录仪,数字播放器,第三年,易怒的,ggplot2
系统要求
统一资源定位地址
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建议 针织物(>= 1.17),rmarkdown公司(>= 1.6),测试那个(>= 1.0.2),UpSetR(升级程序)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 元邻居_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 元邻居_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) 元邻居_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) 元邻居_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaNeighbor网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/MetaNeighbor
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MetaNeighbor网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MetaNeighbor网站/
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