马斯林2
“人口尺度Meta-omics研究中的多变量关联发现”
生物导体版本：释放（3.19）
MaAsLin2是一个全面的R包，用于有效地确定临床元数据和微生物代谢特征之间的多变量关联。MaAsLin2依赖于通用线性模型来适应大多数现代流行病学研究设计，包括横截面和纵向，并提供各种数据探索、归一化和转换方法。MaAsLin2是MaAsLin的下一代。
作者：Himel Mallick[aut]、Ali Rahnavard[aut'、Lauren McIver[aut、cre]
维护人员：Lauren McIver<Lauren.j.McIver at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“Maaslin2”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“Maaslin2”）
细节
| 生物视图 |
基因组,微生物组,规范化,软件 |
| 版本 |
1.18.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.10（R-3.6）（4.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=3.6） |
| 进口 |
鲁棒基地,比格尔姆,pcaPP公司,边缘R,宏基因组eq,pbapply（应用程序）,汽车,数字播放器,素食主义者,化学计量学,ggplot2,情势图,登录中,数据表,lmer测试,搞砸,optparse（操作程序）、grDevices、stats、utils、，通用TMB,MASS（质量）,cplm公司,pscl公司,lme4公司,易怒的 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
http://huttenhower.sph.harvard.edu/maaslin2 |
| 错误报告 |
https://github.com/biobakery/maaslin2/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
