MSnID（MSnID）

LC-MSn蛋白质组鉴定可信度的探索和评估实用程序

生物导体版本：释放（3.19）

从mzIdentML（利用mzID包）或文本文件中提取MS/MS ID数据。在对来自多个数据集的搜索结果进行排序后，它会评估其识别质量并优化筛选标准，以实现最大识别数，同时不超过指定的错误发现率。还包含一些实用程序，用于探索MS/MS结果，评估遗漏和不规则酶切、质量测量准确性等。

作者：Vlad Petyuk与Laurent Gatto的贡献

维护人员：弗拉德·佩特尤克（Vlad Petyuk）

引文（从R中输入引文（“MSnID”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MSnID”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“MSnID”）

生物视图	免疫肿瘤学,质谱学,蛋白质组学,软件
版本	1.38.0
在生物导体中	BioC 3.0（R-3.1）（9.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=2.10），卢比
进口	M数据库(>= 1.12.1),mz标识(>= 1.3.5),R.cache公司,foreach公司,do并行，并行，方法，迭代器,数据表,博科生物,前遗传学,重塑2,数字播放器,毫兹罗,仿生风格,msms测试,ggplot2,RUnit（运行单位）,生物遗传学,生物串,呜呜声,爱尔兰航空公司,字符串,易怒的,批注中心,注释Dbi,可发送的
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MSnID_1.38.0.tar.gz公司
Windows二进制	MSnID_1.38.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	MSnID_1.38.0.tgz
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSnID
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MSnID
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSnID/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MSnID/
软件包下载报告	下载统计信息