MSA2分布

MSA2dist使用自定义得分矩阵计算DNAStringSet或AAStringSet的所有序列之间的成对距离，并进行基于密码子的分析

生物导体版本：释放（3.19）

MSA2dist使用自定义得分矩阵计算DNAStringSet或AAStringSet的所有序列之间的成对距离，并进行基于密码子的分析。它使用评分矩阵用于这些成对距离计算，可以适应DNA或AA字符的任何评分。例如，通过使用文字距离，MSA2dist计算两两IUPAC距离。

作者：克里斯蒂安·乌尔里希

维护人员：Kristian K Ullrich<Ullrich at evolbio.mpg.de>

引文（从R中输入引文（“MSA2dist”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MSA2dist”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“MSA2dist”）

生物视图	对齐,GO（开始）,遗传学,排序,软件
版本	1.8.0
在生物导体中	生物柴油3.15（R-4.2）（2年）
许可证	GPL-3+文件许可证
取决于	R（>=4.4.0）
进口	卢比，生物管柱,基因组范围,I范围，ape，doParallel，dplyr，foreach，方法，并行，pwalling（pwallign）、rlang、seqinr、stats、stringi、stringr、tibble、tidyr、utils
系统要求	C++11语言
统一资源定位地址	https://gitlab.gwdg.de/mpievolbio-it/MSA2dist https://mpievolbio-it.pages.gwdg.de/MSA2dist/
错误报告	https://gitlab.gwdg.de/mpievolbio-it/MSA2dist/issues网站

建议	rmarkdown、knitr、devtools、testtat、ggplot2、，仿生风格
链接到	Rcpp、Rcpp线程
增强功能
取决于我
导入我	双重麻烦
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MSA2列表_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	MSA2dist_1.8.0.zip
macOS二进制（x86_64）	MSA2dist_1.8.0.tgz
macOS二进制（arm64）	MSA2dist_1.8.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSA2dist
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MSA2dist
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSA2dist/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MSA2dist/
软件包下载报告	下载统计信息