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财政部2

多目标因素分析v2


生物导体版本:释放(3.19)

MOFA2包包含一系列用于培训和分析多经济因素分析(MOFA)的工具。MOFA是一种概率因子模型,旨在从包含多个组学层和/或样本组的数据集中识别变化主轴。可以使用MEFISTO框架合并样本的其他时间或空间信息,该框架是MOFA2的一部分。下游分析功能可用于检查每个因子的分子特征,即化、插补等。

作者:里卡德·阿格拉盖[aut,cre],达米安·阿诺尔,Danila Bredikhin[aut],布丽塔·维尔滕[aut]

维护人员:Ricard Argelaguet在gmail.com>

引文(从R中输入引文(“MOFA2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MOFA2”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MOFA2”)
下游分析:概述 HTML格式 R脚本
MEFISTO模拟数据(暂时) HTML格式 R脚本
MOFA2:如何在R中训练模型 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
许可证 文本

细节

生物视图 贝叶斯主义者尺寸缩减软件可视化
版本 1.14.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 文件许可证
取决于 R(>=4.0)
进口 rhdf5型数字播放器第三年重塑2情势图ggplot2、方法、,R彩色啤酒奶牛场gg排斥网状的HDF5阵列,gr设备,统计,马格里特对于猫,实用程序,校正图延迟阵列Rtsne公司超高速蛇怪斯特林吉
系统要求 Python(>=3),numpy,pandas,h5py,scipy,argparse,sklearn,mofapy2
统一资源定位地址 https://biofam.github.io/MOFA2/index.html
错误报告 https://github.com/bioFAM/MOFA2网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MOFA2_1.14.0.tar.gz号文件
Windows二进制 MOFA2_1.14.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) 科威特财政部2_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64) 科威特财政部2_1.14.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MOFA2网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MOFA2
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MOFA2网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MOFA2/
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