MBECS系统

微生物组数据中批量效应的评估和校正


生物导体版本:释放(3.19)

微生物组分批效应校正套件(MBECS)提供了一组功能,用于评估和缓解分批加工产生的未经处理的噪音。为此,它结合了来自不同软件包的大量批纠正算法(BECA)。此外,它还提供了一个校正和报告管道,可以初步了解批量效应校正前后数据集的特征。

作者:迈克尔·奥尔布里奇

维护人员:迈克尔·奥尔布里奇(Michael Olbrich)<M.Olbrich-at-protonmail.com>

引文(从R中输入引文(“MBECS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MBECS”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“MBECS”)
MBECS简介 HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 BatchEffect(批次效果),微生物组,规范化,质量控制,报告写作,软件,可视化
版本 1.8.0
在生物导体中 生物柴油3.15(R-4.2)(2.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.1)
进口 方法,马格里特,类毒素,利马,lme4公司,lmer测试,情势图,rmarkdown公司,集群,数字播放器,ggplot2,额外网格,ruv(俄罗斯),特别行政区,易怒的,第三年,素食主义者,统计,实用程序,矩阵
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/rmolbrich/MBECS网站
错误报告 https://github.com/rmolbrich/MBECS/issues/new
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MBECS_1.8.0.tar.gz公司
Windows二进制 MBECS_1.8.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) MBECS_1.8.0.tgz公司
macOS二进制(arm64) MBECS_1.8.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBECS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MBECS
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MBECS网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MBECS/
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