MAPFX公司
大规模并行流式细胞术Xplorer（MAPFX）：分析大规模并行细胞术实验数据的工具箱
生物导体版本：释放（3.19）
MAPFX是一个端到端的工具箱，用于预处理MPC实验的原始数据（例如，BioLegend的LEGENDScreen和BD Lyoplates分析），并在没有这些测量的情况下，进一步插补井中“缺失”的无限标记。该流水线首先对原始强度进行背景校正，通过采用正指数卷积模型去除电子基线恢复和荧光补偿中的噪声。然后使用带有平板、柱和行因子的对数正态模型去除来自井效应等来源的不需要的技术变化，然后使用信息主干标记作为预测因子输入无限标记。然后，可以使用完成的数据集进行聚类和其他统计分析。此外，MAPFX还可用于使FFC分析数据正常化。
作者：小池寮[aut，cre]
，阿古斯·萨利姆[ctb]，无限流量[ctb]
维护人员：廖小池<chelsea.acad at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MAPFX”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“MAPFX”）
细节
| 生物视图 |
基于细胞的分析,群集,流式细胞术,蛋白质组学,单个单元格,软件 |
| 版本 |
1.0.0 |
| 在生物导体中 |
生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
GPL-2型 |
| 取决于 |
R（>=4.4.0） |
| 进口 |
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| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/Shoiao ChiLiao/MAPFX |
| 错误报告 |
https://github.com/xiaoChiLiao/MAPFX/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
