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机械-器具插补


生物导体版本:释放(3.19)

代谢组学中缺失数据插补的两步方法。步骤1使用随机森林分类器将缺失值分类为完全随机缺失/随机缺失(MCAR/MAR)或非随机缺失(MNAR)。由于在代谢组学数据中很难区分这两种缺失类型,因此将MCAR/MAR合并。步骤2使用适当的插补算法,根据分类的缺失机制插补缺失值。经测试并可用于MCAR/MAR的插补算法包括贝叶斯主成分分析(BPCA)、多重插补无跳过K-最近邻(Multi_nsKNN)和随机森林。经测试并可用于MNAR的插补算法包括nsKNN和一种单一插补方法,用于插补存在左偏的代谢物。

作者:Jonathan Dekermanjian[aut,cre],Elin Shaddox[aut],Debmalya Nandy[aut',Debashis Ghosh[aut],Katerina Kechris[aut

维护人员:Jonathan Dekermanjian<乔纳森。德克曼建在CUAnschutz.edu>

引文(从R中输入引文(“MAI”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MAI”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MAI”)
利用机械软件插补(MAI) HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 分类,代谢组学,软件,统计方法
版本 1.10.0
生物柴油3.14(R-4.1)(3年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5.0)
进口 插入符号,平行,doParallel(并行),前臂,e1071号,未来应用程序,未来,miss森林,pca方法,潮汐,stats,utils,方法,总结性实验,S4矢量
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/KechrisLab/MAI网站
错误报告 https://github.com/KechrisLab/MAI/问题
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程序包档案

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源程序包 MAI_1.10.0.tar.gz号
Windows二进制 MAI_1.10.0.zip号(仅64位)
macOS二进制(x86_64) MAI_1.10.0.tgz号
macOS二进制(arm64) MAI_1.10.0.tgz号
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MAI
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MAI
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MAI网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MAI网站/
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