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机械-器具插补
生物导体版本:释放(3.19)
代谢组学中缺失数据插补的两步方法。步骤1使用随机森林分类器将缺失值分类为完全随机缺失/随机缺失(MCAR/MAR)或非随机缺失(MNAR)。由于在代谢组学数据中很难区分这两种缺失类型,因此将MCAR/MAR合并。步骤2使用适当的插补算法,根据分类的缺失机制插补缺失值。经测试并可用于MCAR/MAR的插补算法包括贝叶斯主成分分析(BPCA)、多重插补无跳过K-最近邻(Multi_nsKNN)和随机森林。经测试并可用于MNAR的插补算法包括nsKNN和一种单一插补方法,用于插补存在左偏的代谢物。
作者:Jonathan Dekermanjian[aut,cre],Elin Shaddox[aut],Debmalya Nandy[aut',Debashis Ghosh[aut],Katerina Kechris[aut
维护人员:Jonathan Dekermanjian<乔纳森。德克曼建在CUAnschutz.edu>
安装
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如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MAI”)
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文档
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细节
生物视图 |
分类,代谢组学,软件,统计方法 |
版本 |
1.10.0 |
自 |
生物柴油3.14(R-4.1)(3年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
插入符号,平行,doParallel(并行),前臂,e1071号,未来应用程序,未来,miss森林,pca方法,潮汐,stats,utils,方法,总结性实验,S4矢量 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/KechrisLab/MAI网站 |
错误报告 |
https://github.com/KechrisLab/MAI/问题 |
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程序包档案
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