MACSr公司

MACS:基于模型的ChIP-Seq分析


生物导体版本:释放(3.19)

基于模型的ChIP-Seq分析(MACS)是一个广泛使用的用于识别转录因子结合位点的工具包。此包装是最新MACS3的R包装。

作者:胡强[aut,cre]

维护人员:胡强<强。胡在roswellpark.org>

引文(从R中输入引文(“MACSr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MACSr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignets(“MACSr”)
MACSr公司 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 ATAC当量,ChIPSeq公司,免疫肿瘤学,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物柴油3.13(R-4.1)(3.5年)
许可证 BSD_3_clause+文件许可证
取决于 R(>=4.1.0)
进口 实用程序,网状的,S4载体,方法,蛇怪,实验中心,批注中心
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 测试那个,针织者,市场营销,仿生风格,MACS数据
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MACSr_1.12.0.tar.gz公司
Windows二进制
macOS二进制(x86_64) MACSr_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) MACSr_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MACSr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MACSr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MACSr/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MACSr/
软件包下载报告 下载统计信息