InPAS公司

从RNA-seq数据中识别新的选择性多腺苷酸化位点（PAS）

生物导体版本：释放（3.19）

选择性多腺苷酸化（APA）是发生在大多数人类基因中的重要转录后调控机制之一。InPAS有助于从RNA-Seq数据中发现新的APA位点和APA位点的差异使用。它利用cleanUpdTSeq通过删除虚假站点来微调已识别的APA站点。

作者：欧建宏[aut，cre]，刘海波[aut]，朱丽叶[aut]Lihua Julie Zhu，Sungmi M.Park[aut'，Michael R.Green[aut]

维护人员：欧建宏（Jianhong Ou）<杜克教育学院的欧建宏>

引文（从R中输入引文（“InPAS”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“InPAS”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“InPAS”）

生物视图	选择性聚腺苷化,聚腺苷酸化位点的差异使用,基因调控,转录组测序,软件,转录
版本	2.12.0
在生物导体中	生物技术3.1（R-3.2）（9年）
许可证	GPL（>=2）
取决于	R（>=3.5.0）
进口	注释Dbi,批处理工具,博科生物,生物串,牛基因组,清理上TSeq,depmixS4公司,数字播放器,一大群,未来,未来应用程序,基因组信息数据库,基因组范围,基因组学特征,ggplot2,I范围,利马,马格里特、方法、，平行地,plyranges系列,预处理核心,阅读器,重塑2,RSQ网站，统计，S4载体，实用程序
系统要求
统一资源定位地址

建议	生物遗传学,生物技术经理,仿生风格,英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC毫米10,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,EnsDb公司。哈皮恩斯v86,EnsDb公司。Mmusculus.v79,针织者,降价,rmarkdown公司,rtracklayer公司,RUnit（运行单位），gr设备，TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,TxDb（发送日期）。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.known基因
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跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	InPAS_2.12.0.tar.gz中
Windows二进制	InPAS_2.12.0.zip格式
macOS二进制（x86_64）	InPAS_2.12.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	InPAS_2.12.0.tgz公司
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/InPAS
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/InPAS
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/InPAS/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/InPAS/
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