离子加速器

牛津纳米孔MinION数据的质量评估工具

生物导体版本：释放（3.19）

IONiseR为Oxford Nanopore Mineion数据的质量评估提供了工具。它从一组fast5文件中提取摘要统计信息，可以在基本调用之前或之后使用。除了生成的读类型的标准摘要外，它还提供了许多图，用于可视化与实验运行时间相关的指标或流动单元表面上的空间指标。

作者：迈克·史密斯

维护人员：迈克·史密斯（Mike Smith）

引文（从R中输入引文（“IONiseR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“IONiseR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“IONiseR”）

生物视图	数据导入,质量控制,排序,软件
版本	2.28.0
在生物导体中	生物技术3.2（R-3.2）（9年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.4）
进口	rhdf5型,数字播放器,马格里特,第三年,短读,生物串,ggplot2、方法、，生物遗传学,十六矢量,易怒的，统计，生物并行,位64,字符串，实用程序
系统要求
统一资源定位地址

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司,额外网格,测试那个,从属摘要数据
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	离子传感器_2.28.0.tar.gz
Windows二进制	IONiseR_2.28.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	IONiseR_2.28.0.tgz
macOS二进制（arm64）	IONiseR_2.28.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IONiseR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/IONiseR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/IONiseR网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/IONiseR网站/
软件包下载报告	下载统计信息