国际会计师联合会
微生物组分析中绝对丰度的稳健推断
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包提供了一种稳健的方法来推断生态系统中协变量与微生物绝对丰度（AA）的关联。它还可以直接应用于相对丰度（RA）数据，对AA进行推断，因为两个RA的比率等于它们的AA的比率。该算法可以在调整潜在混杂因素的同时估计和测试感兴趣的关联。这种方法的估计值像典型的回归分析一样易于解释。高维协变量通过正则化处理，并通过并行计算实现。该方法可以自动控制错误发现率。分析时不需要用正值来插补零。IFAA包还提供了“MZILN”功能，用于估计和测试丰度比与协变量的关联。
作者：古兰经Wu[aut]，李志刚[aut，cre]
维护人员：李志刚＜lzg2151在gmail.com＞
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“IFAA”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览Vignets（“IFAA”）
细节
| 生物视图 |
微生物组,回归,排序,软件,技术 |
| 版本 |
1.6.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.17（R-4.3）（1年） |
| 许可证 |
GPL-2型 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0） |
| 进口 |
mathjaxr公司,doRNG公司,foreach公司(>= 1.4.3),矩阵(>= 1.4-0),HDCI公司（>=1.0-2），平行（>=3.3.0），do并行(>= 1.0.11),平行地,格尔姆奈特，统计，实用程序，摘要实验,字符串,S4载体,描述工具,额外矩阵，方法 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35241863/ https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30923584/ https://github.com/quranwu/IFA网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/quranwu/IFAA/issues网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
