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人类转录本简编

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181000人类转录组测序研究简编使用的工具


生物导体版本:释放(3.19)

提供用于处理人类转录组序列简编(最初为htxcomp)的工具。

作者:肖恩·戴维斯、文斯·凯里

维护人员:VJ Carey在channing.harvard.edu>

引文(从R中输入引文(“人类转录本纲要”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“HumanTranscriptomeCompendium”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“人类文字汇编”)
HumanTranscriptomeCompendium——已测序人类转录组的云端集合 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 基础设施,软件,转录组学
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.6)
进口 闪亮的,ssrch公司,S4载体,总结性实验,实用程序,生物技术经理
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 针织者,仿生风格,蜂群,tximportData(最大端口数据),数据传输时间,tximport(最大端口),数字播放器,马格里特,生物文件缓存,测试那个,rhdf5客户端,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 人类抄本简编_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 HumanTranscriptome简编_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64) 人类转录本汇编_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 人类抄本简编_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HumanTranscriptome简编
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/HumanTranscriptomeCompendium
包短Url https://bioconductor.org/packages/HumanTranscriptome简编/
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