HPiP公司
宿主-病原相互作用预测
生物导体版本：释放（3.19）
HPiP（宿主-病原相互作用预测）使用集成学习算法预测宿主-病原蛋白相互作用（HP-PPI），该算法使用从宿主和病原蛋白的氨基酸组成计算的结构和物理化学描述符。提出的包可以有效地解决HP-PPI网络重建中的数据短缺和数据不可用问题。此外，在这方面建立计算框架将揭示对传染病的机制性见解，并建议潜在的HP-PPI目标，从而缩小后续湿式实验室实验验证的可能候选范围。
作者：Matineh Rahmatbakhsh[aut，trl，cre]，Mohan巴布[led]
维护人员：马蒂内·拉赫马塔巴赫什（Matineh Rahmatbakhsh）<matinerb.94 at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“HPiP”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“HPiP”）
细节
| 生物视图 |
基因预测,网络,网络推理,蛋白质组学,软件,结构预测,系统生物学 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.1） |
| 进口 |
数字播放器(>= 1.0.6),高温气冷堆(>= 1.4.2),阅读器,第三年,易怒的，实用程序，字符串,马格里特,插入符号,校正图,ggplot2,pROC公司,PRROC公司,记录仪，图形，统计数据，呜呜声，gr设备，绘制,MCL公司 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/mrbakhsh/HPiP |
| 错误报告 |
https://github.com/mrbakhsh/HPiP/issues（网址：https://github.com/mrbakhsh/HPiP/issues） |
查看更多
| 建议 |
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| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 链接到我 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
