GeneTonic公司
享受分析和整合差异表达分析和功能丰富分析的结果
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包提供了将现有转录组数据和结果组合在一起的功能，从而更容易生成有洞察力的观察和假设。使用Shiny应用程序可以轻松使用它，它结合了交互性和再现性的优点，例如通过捕获实时会话中突出显示的感兴趣的功能和基因集，以及创建一个HTML报告作为文本、代码和输出共存的工件。使用GeneTonicList作为所有必需组件的标准化容器，可以简化多个可视化和摘要的生成。
作者：费德里科·马里尼[aut，cre]
，Annekathrin Ludt[aut]
维护人员：费德里科·马里尼<marinif在uni mainz.de>
引文（从R中输入引文（“GeneTonic”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“GeneTonic”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“GeneTonic”）
细节
| 生物视图 |
注释,差异表达式,GO（开始）,图形用户界面,基因表达式,GeneSet扩展,路径,报告写作,ShinyApps公司,软件,转录,转录组学,可视化 |
| 版本 |
2.8.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.11（R-4.0）（4.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.0.0） |
| 进口 |
注释Dbi,骨干,bs4现金(>= 2.0.0),绕圈子,色彩空间,颜色选择器,复杂热图,复杂翻转,右旋糖,DESeq2公司,数字播放器,DT公司,动态树剪切,矩阵指数函数,gg力,ggplot2(>= 3.5.0),gg排斥,ggridges公司,政府.db，图形，grDevices，网格，记录仪,矩阵统计、方法、，巧妙地,R彩色啤酒,林特罗斯,爱尔兰航空公司,rmarkdown公司,S4载体,规模,闪亮的,闪耀王牌,小型装载机,闪亮小工具，统计，总结性实验,第三年,醉醺醺的、工具、实用程序，翡翠色,visNetwork（可视网络） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/federicomarini/GeneTonic网站 |
| Bug报告 |
https://github.com/federicomarini/GeneTonic/issues网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
