结果IT2
基于多组学数据寻找有影响力的TF和Target
生物导体版本:释放(3.19)
该包实现了根据不同输入类型查找有影响力的TF和目标的功能。它有五个模块:多峰多基因注释(mmPeakAnno模块)、计算调节电位(calcRP模块还有一些其他有用的功能,比如集成不同的源信息,计算TF的雅卡相似度。
作者:关东商[aut,cre]
维护人员:关东商报
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“FindIT2”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“FindIT2”)
细节
生物视图 |
ATACSeq公司,注释,ChIPSeq公司,基因调控,基因目标,多重比较,软件 |
版本 |
1.10.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
基因组范围,R(>=3.5.0) |
进口 |
用r,生物遗传学,基因组信息数据库,rtracklayer公司,S4载体,基因组特征,数字播放器,爱尔兰航空公司,拼凑,ggplot2,生物并行,q值,字符串,实用程序,统计信息,gg排斥,易怒的,第三年,总结性实验,多重分析实验,I范围,进步,呜呜声,格尔姆奈特,方法 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/shangguandong1996/FindIT2 |
错误报告 |
https://support.bioconductor.org/t/FindIT2网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。