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结果IT2

基于多组学数据寻找有影响力的TF和Target


生物导体版本:释放(3.19)

该包实现了根据不同输入类型查找有影响力的TF和目标的功能。它有五个模块:多峰多基因注释(mmPeakAnno模块)、计算调节电位(calcRP模块还有一些其他有用的功能,比如集成不同的源信息,计算TF的雅卡相似度。

作者:关东商[aut,cre]

维护人员:关东商报

引文(从R中输入引文(“FindIT2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“FindIT2”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“FindIT2”)
FindIT2简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 ATACSeq公司,注释,ChIPSeq公司,基因调控,基因目标,多重比较,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 基因组范围,R(>=3.5.0)
进口 用r,生物遗传学,基因组信息数据库,rtracklayer公司,S4载体,基因组特征,数字播放器,爱尔兰航空公司,拼凑,ggplot2,生物并行,q值,字符串,实用程序,统计信息,gg排斥,易怒的,第三年,总结性实验,多重分析实验,I范围,进步,呜呜声,格尔姆奈特,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/shangguandong1996/FindIT2
错误报告 https://support.bioconductor.org/t/FindIT2网站
查看更多
建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司,sessioninfo(会话信息),测试那个(>= 3.0.0),TxDb(发送日期)。阿塔利亚纳。生物集市.plantsmart28
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 查找IT2_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 查找IT2_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64) 查找IT2_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) 查找IT2_1.10.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FindIT2
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/FindIT2
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/FindIT2/
包短Url https://bioconductor.org/packages/FindIT2/
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