过滤器FFPE

NGS数据的FFPE人工嵌合读取滤波器

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包发现并过滤在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织的下一代测序（NGS）过程中专门生成的人工嵌合体读取。这些人工嵌合读取可能导致大量假阳性结构变异（SV）调用。所需输入是FFPE样本的索引BAM文件。

作者：魏兰英[aut，cre]

维护人员：魏兰英<Lanying.Wei在慕尼黑大学>

引文（从R中输入引文（“FilterFFPE”）)以下为：

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“FilterFFPE”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“过滤器FFPE”）

生物视图	对齐,预处理,质量控制,排序,软件,结构变化
版本	1.14.0
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年）
许可证	LGPL-3型
取决于
进口	foreach公司,do并行,基因组范围,I范围,Rsamtools公司，平行，S4载体
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	过滤器FFPE_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	过滤器FFPE_1.14.0.zip
macOS二进制（x86_64）	过滤器FFPE_1.14.0.tgz
macOS二进制（arm64）	过滤器FFPE_1.14.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FilterFFPE（过滤FFPE）
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/FilterFFPE
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/FilterFFPE网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/FilterFFPE（过滤器FFPE）/
软件包下载报告	下载统计信息