FELLA公司

代谢组学数据的解释和富集


生物导体版本:释放(3.19)

使用KEGG条目丰富代谢组学数据。给定一组受影响的化合物,FELLA建议在知识模型网络中使用标签传播来建议受影响的反应、酶、模块和路径。由此产生的子网络可以可视化并导出。

作者:塞尔吉奥·皮卡特·阿尔马达[aut,cre],弗朗西斯科·费尔南德斯·阿尔伯特[aut],亚历山大·佩雷拉·卢纳[aut]

维护人员:塞尔吉奥·皮卡特·阿尔马达(Sergio Picart-Armada)

引文(从R中输入引文(“FELLA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“FELLA”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“FELLA”)
示例:小家鼠脂肪肝研究 PDF格式 R脚本
示例:金头鲷体内的苯氧酮暴露 PDF格式 R脚本
FELLA公司 PDF格式 R脚本
快速入门 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 GO(开始),图形和网络,KEGG公司,代谢组学,网络,网络丰富,路径,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5.0)
进口 方法,记录仪,矩阵,KEGGREST公司,普利尔,统计,图形,实用程序
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 闪亮的,DT公司,马格里特,visNetwork(可视网络),针织物,仿生风格,rmarkdown公司,测试那个,生物反应器,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,注释Dbi,GOSemSim公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 FELLA_1.24.0.tar.gz(美元)
Windows二进制 FELLA_1.24.0.zip(拉链)
macOS二进制(x86_64) FELLA_1.24.0.tgz(美元)
macOS二进制(arm64) FELLA_1.24.0.tgz(美元)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FELLA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/FELLA
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/FELLA网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/FELLA/
软件包下载报告 下载统计信息