事件指针
利用连接阵列和RNA-Seq数据有效识别选择性剪接事件
生物导体版本：释放（3.19）
EventPointer是一个R包，用于识别涉及简单（病例对照实验）或复杂实验设计（如时间进程实验和包括配对样本的研究）的替代剪接事件。该算法可用于分析来自连接阵列（Affymetrix阵列）或测序数据（RNA-Seq）的数据。软件返回一个带有检测到的选择性剪接事件的数据帧：基因名称、事件类型（盒、选择性3'等）、基因组位置、统计显著性和所有事件的剪接百分比增量（Delta PSI）。该算法可以生成一系列文件来可视化IGV中检测到的选择性剪接事件。这简化了结果的解释和标准PCR验证引物的设计。
作者：胡安·巴勃罗·罗梅罗[aut]、胡安·费雷尔·邦索姆斯[aut，cre]、巴勃罗·萨克里斯坦[aut]]、安德尔·穆尼亚泰奎[aut]、费尔南多·卡拉佐[aut〕、安德尔·阿拉姆布鲁[aut】、安吉尔·鲁比奥[aut'
维护人员：胡安·费雷尔·邦索姆（Juan A.Ferrer-Bonsoms）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“事件指针”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“事件指针”）
细节
| 生物视图 |
交替拼接,差分拼接,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件,时间课程,转录,mRNA微阵列 |
| 版本 |
3.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物活性炭3.5（R-3.4）（7年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.5.0），SGSeq公司,矩阵,总结性实验 |
| 进口 |
基因组特征,字符串,基因组信息数据库,记录仪,MASS（质量）,nnls公司,利马,矩阵统计,苏格兰皇家银行,前驱体,图表，方法，实用程序，统计信息，do并行,foreach公司,affxparser软件,基因组范围,S4载体,I范围,q值,玉米棒,rhdf5型,牛基因组,生物串,格尔姆奈特,阿比德,迭代器,lpSolve解决方案,波宾,速度glm,tximport（最大端口）,fgsea公司 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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| 错误报告 |
https://github.com/jpromeror/EventPointer/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
